詔安營遊擊一員（駐詔安縣治）、守備一員（駐詔安縣治）、紅花嶺汛守備一員（乾隆八年設）、千總二員、把總四員、白葉村汛把總一員（乾隆九年設）、外委千總二員、紅花嶺汛外委千總一員、外委把總四員、白葉村汛外委把總一員、額外外委四員，馬戰兵四十五名（外委額外在內）、步戰兵二百八十四名、守兵四百三十一名，兵戰馬四十五匹。一分防懸鐘宮口汛兼轄洋林龜山砲臺、洋尾河岸、渡頭庵、三礁等汛，一分防分水關砲臺兼轄琉璃嶺、港頭、橋頭等塘汛，一分防梅嶺寨汛兼轄鳳山、菜園埔、半山、松柏門等塘汛，一分防金溪汛兼轄梅林徑、梅仔坑、前洋、長浦、龍充等塘汛，一駐防紅花嶺汛兼轄埤頭、赤嶺峽子崎、合溪等塘汛，一駐防白葉村汛兼轄麻寮、坪路等塘汛。
平和營（原系漳州鎮標左營，嘉慶二十年改定）遊擊一員（駐平和縣治）、守備一員（駐琯溪汛）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委三員，馬戰兵四十三名（外委額外在內）、步戰兵二百六十一名、守兵三百九十二名，兵戰馬四十三匹。一駐防平和縣兼轄黃莊、大協崎、嶺■〈氵〈癶上示下〉〉頭、赤石、柏松關、新路、新橋等塘汛，一駐防琯溪汛兼轄小坪關、霞寨、豬母額嶺、豐埔、舊縣、洪瀨、火燄徑、挨礱石、黃井、徑口等塘汛，一分防南勝汛兼轄三角徑、石出水、松囝鞍、徑頭、長潭面、雙溪墟等塘汛，一分防庵後汛兼轄大溪、伯公座、龍過崗、石梯嶺、佛髻嶺等塘汛，一分防車田汛兼轄石榴坂、三角徑、內山城、塗景寨、巖前溪等塘汛。
龍岩營（舊系漳州鎮左營）遊擊一員（駐龍巖州）、守備一員（駐漳平縣）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，馬戰兵四十三名（外委額外在內）、步戰兵三百九十九名、守兵三百九十名，兵戰馬四十三匹。一駐劄龍巖州兼轄雁石山、望嶺、釆眉嶺、汶水溪下、老平林、大池、小池、龍門船巷、王莊、上家邦等汛，一駐防漳平縣兼轄華口、羅溪口、鹽場、舅姑嶺、打石坑、和睦、長安、京口、小溪等塘汛，一分防寧洋縣兼轄馬山坑、源山榖、十一湖、大窯、公館、外利溪、內利溪、蘇坂、小溪、賜福亭、城口、曳船等塘汛，一分防林田關兼轄九車溪、前林盂、頭馬坑、大灣、博平嶺、三井等塘汛，一分防永福汛兼轄馬岐林、石門隔、三重嶺等塘汛，一分防茶林盂汛，一分防溪口汛兼轄白沙、小吉等塘汛。
雲霄營遊擊一員（駐雲霄鎮）、守備一員（駐雲霄鎮）、千總二員、把總四員（原三員，雍正十一年添設）、外委千總二員、外委把總四員、額外外委三員，馬戰兵三十九名（外委額外在內）、步戰兵二百五十名、守兵三百七十八名，兵戰馬三十九匹。一分防員仔嶺兼轄官道、木柵寨、盤陀嶺、古樓、官津橋、七里鋪、樹洞、松仔鞍等塘汛，一分防岳坑、水晶、小場汛兼轄徑仔村、南嶺門等塘汛，一分防荷步汛、石蛇尾兼轄下寨、高塘、臺高溪、浯田、廖家樓、烏坵等塘汛，一分防白狗洞汛兼轄官波頭、竹仔前、馬山、貓獅橋等塘汛，一分防梅洲汛兼轄公子店、大興、林公、雙見嶺、羅公宅、虎扒樹等塘汛，一分防梅安汛兼轄三腳寮、大水窟、八尺門等塘汛。
水師提標（轄本標中、左、右、前、後五營，節制金門、海壇、臺灣、南澳並福寧五鎮，並聽閩浙總督節制）
提督總兵官一員，駐同安縣。
中營參將一員（駐劄海澄縣）、守備一員（駐海澄縣）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵四百三十八名（外委額外在內）、守兵四百十三名（舵工在內），戰船見船政泉州廠。一駐泊廈門，一分防浯嶼汛，一分防浯嶼汛南北兩處砲臺，一扼守巡防大逕港口，一巡防深塢澳口，一防守島塢汛，一巡防海門汛，一防守高崎汛，一防守海澄溶川、碼青埔、圭嶼等汛，一防守廈門港砲臺，一巡查卓崎、大逕口，一配船出洋巡緝。
左營遊擊一員（駐劄龍溪縣）、石碼守備一員（駐廈門）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵四百四十三名（外委額外在內）、守兵四百十三名（舵工在內），戰船見船政漳州廠。一駐防石碼汛，一隨泊廈門，一瞭望五通山頂，一分防福滸塘，一協防小擔汛，一防守蛟塘馬、廈門港砲臺，一配船出洋巡緝。
右營遊擊一員（駐劄廈門）、守備一員（巡查內海）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵四百四十三名（外委額外在內）、守兵四百十三名（舵工在內），戰船見船政泉州廠。一隨泊廈門，一防守三■〈氵义〉河城寨並防玉洲汛兼轄澳頭、東尾、石美、許茂、烏嶼等汛，一大擔山頂瞭望，一防守廈門港砲臺，一輪值防守大擔後砲臺、大擔門水汛，一配船出洋巡緝。
前營遊擊一員（駐劄廈門）、守備一員（駐廈門）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵四百四十三名（外委額外在內）、守兵四百十三名（舵工在內），戰船見船政漳州廠。一隨防廈門，一分防橋梁尾、海滄兼轄三都鼎尾、新垵礁、排頭門等汛，一瞭望南關山頂，一分防嵩嶼汛，一分防安海、鼓浪嶼、黃厝社砲臺、水摻臺，一瞭望白石頭山頂，一分防廈門港砲臺，一扼守大擔門水汛，一配船出洋巡緝。
後營遊擊一員（駐劄廈門）、守備一員（駐劄廈門）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵四百四十三名（外委額外在內）、守兵四百十三名（舵工在內），戰船見船政漳州廠。一隨泊廈門，一瞭望廈門深山頂，一瞭望廈門金雞亭山頂，一分防劉五店汛兼轄潯尾、■〈氵丙〉洲、澳頭、高浦、馬鑾、石潯、潯尾、坂頭等汛，一瞭望劉五店汛高埠，一防守坂頭汛，一防守大擔汛，一防守白石頭、聖林塘，一防守廈門港砲臺。
海壇鎮（轄本標左、右二營及閩安協，聽總督及水師提督節制）
總兵官一員，駐福清縣海壇汛。
左營遊擊一員（駐海壇汛）、守備一員（駐海壇汛）、千總二員、把總四員、外委千總三員、外委把總六員、額外外委五員，步戰兵四百九十四名（外委額外在內）、守兵四百三十八名（舵工在內），戰船見船政福州廠、泉州廠。一駐防海壇汛，一看守平磹砲臺汛，一瞭望君山，一瞭望大陳山，一扼守小陳汛，一分防磁澳一帶水汛並瞭望磁澳山頂，一分防月輪班扼守鹽埕澳兼防鐘門汛並瞭望葫蘆澳山頂，一防守鼓嶼門並瞭望鼓嶼山頂汛，一哨防萬安一帶水汛，一分防旂竿尾、小練嶼頭並瞭望大練山頂。
右營遊擊一員（駐海壇汛）、守備一員（駐海壇汛）、千總二員、把總四員、外委千總三員、外委把總六員、額外外委四員，步戰兵四百九十四名（外委額外在內）、守兵四百二十六名（舵工在內），戰船見船政泉州廠。一分防海壇汛、一看守平潭砲臺汛，一分防觀音澳汛，一分防娘宮汛並跨海山頂瞭望，一分防南日汛，一分防江陰壁頭汛並砲臺三江水汛，一分防湄州汛，一分防平海汛，一配船出洋巡緝。
閩安協（轄本標左、右二營，聽水師提督、海壇鎮節制）
副將一員（駐閩安鎮城，原為鎮，康熙二十七年改今職）。
左營都司一員（駐閩安鎮城，原遊擊，乾隆三十九年改）、守備一員（駐閩安鎮城）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵三百七十二名（外委額外在內）、守兵三百七十六名（舵工在內），戰船見船政福州廠。一存城，一防守閩安鎮口汛，一防守閩安口對岸巡船，一防守大橋塘汛，一防守南北兩岸並砲臺，一防守亭頭、五虎等汛，一防守琅琦、元寶山、金牌館頭、筆架各塘汛，一分防定海汛，一防守竿塘汛，一防守黃岐汛，一出洋巡緝。
右營都司一員（駐琅琦等處，原遊擊，乾隆三十九年改）、守備一員（駐防琅琦等處）、千總二員、把總四員、外委千總二員、外委把總四員、額外外委四員，步戰兵三百九十二名（外委額外在內）、守兵三百九十二名（舵工在內），戰船見船政福州廠。一分防閩安鎮汛，一防守閩安口對岸巡船南門塘，一駐防南崎等處地方，一防守筆架寨，一防守北茭、濂澳等塘汛，一防守羅湖、東衝等塘汛，一撥配□幫鹽哨，一瞭望羅湖山頂，一瞭望芙蓉山頂，一瞭望大金山頂，一出洋緝匪，一存閩安鎮城。
金門鎮（轄本標左、右二營，聽總督、水師提督節制）
總兵官一員，駐同安縣。
左營遊擊一員、守備一員、千總二員、把總四員、外委千總三員、外委把總六員、額外外委四員，步戰兵四百十六名（外委額外在內）、守兵五百七名（舵工在內），戰船見船政泉州廠。一駐劄金門汛，一撥防烈嶼汛兼瞭望，一撥防金龜尾、許坑等汛並瞭望，一分防金龜尾砲臺，一撥防歐厝、彭林、古寧等汛，一撥防瞭望歐厝，一撥防雙乳山汛，一撥防董水、大嶝、小嶝等汛，一巡防深滬等水汛，一巡防祥芝等水汛，一巡防崇武等水汛，一巡防黃崎等水汛，一瞭望大墜山頂，一帶領兵船出洋巡緝。
右營遊擊一員、守備一員、千總二員、把總四員、外委千總三員、外委把總六員、額外外委四員，步戰兵四百十八名（外委額外在內）、守兵五百五名（舵工在內），戰船見船政泉州廠。一隨防金門汛，一巡防鎮海汛，一巡防井尾等汛，一巡防將軍澳汛，一撥防科羅砲臺，一瞭望田浦山頂，一瞭望峰山頂，一瞭望陳坑山頂，一巡防圍頭等汛，一出洋巡緝。